雾霾对设施农业的负面影响贯穿农作物生长的整个过程，由于其影响温室内温度、湿度、光照等条件，从而在萌芽阶段影响农作物种子萌发并导致幼苗发育不良；在生长发育阶段影响农作物生长发育；在成熟期，影响农作物产量、质量，引起农产品价格不规律波动。

作物萌芽

作物萌芽阶段需要充足的水分、适当的温度和足够的氧气，干燥的种子含水量少、代谢缓慢，不利于种子的生长发芽。而雾霾天气较易发生在温度较低、降雨量较少的自然环境条件下，水分和温度条件不能满足植株萌芽的需求，而且雾霾遮挡光照，会使大棚的生态平衡遭到破坏，缺少光合作用的幼苗较小，生命力脆弱，叶片难以成形，不能正常进入生长阶段。

作物生长

绿色植物具有呼吸作用，植物通过呼吸作用分解物质，增加维持其生命活动所需的能量，还有利于植株对重要有机物的合成，增强植物的抗病能力，有利于植物的新陈代谢。然而雾霾天气下，空气中悬浮尘粒过大，植株难以发挥吸附尘埃的作用；太阳光是其直接热量能源和主导因子，它决定着棚内的光照强度、温度、湿度等诸因子的状况甚至温室的整体环境状况。然而在冬季10-12月份，一旦发生雾霾天气，大棚植物生长所需的温差条件便得不到满足，并且会影响植物的光合作用，而植物的光合作用是提高作物产量的最重要途径，植物的光能利用率较低，会使植株变黄萎缩，作物的产量也会降低。尤其是雾霾遮挡大棚内作物所需的阳光，会造成棚内地温和气温较低、湿度较大，降低植株的抗病能力，增加病虫害的风险。

果实质量、产量

长期雾霾天气使温室大棚蔬菜生长发育不良，产量、质量下降。雾霾灾害会使农作物缺乏在生长过程中所必需的温度和日照，影响果蔬成品的大小和光泽，难以保证果实品质；而且雾霾天气下温度过低，农作物会出现冻害现象，湿度过大，会削弱农作物抵抗病虫害的能力，进而降低农产品产量。雾霾灾害的突发还会致使农产品价格波动，影响农民收入以及导致囤货等恶劣现象发生。雾霾天气频发影响农作物的生产、运输和上市销售，使得农作物产出减少、成本增加，从而价格持续上涨。总之，雾霾不仅影响设施农作物的质量和产量，还影响农产品的销量。