有机韭菜在生产过程中经常出现干尖、根腐、叶枯死株和茎叶腐烂等一些病害症状。但是相同的症状发病原因不一定相同，正确判断其发生原因并及时采取有效防治措施是栽培的关键。
一、干尖
1.土壤酸化。长期大量施入粪稀就会使土壤酸化而引起酸性危害。表现为韭叶生长缓慢、细弱、外叶枯黄。
防治方法：施入足够的有机肥作基肥，调节土壤酸碱度。
2.高温。韭菜生长适宜温度为5～35℃，长期处于35℃以上，连阴后骤晴，或高温后冷风突然侵入，都可能造成叶枯。
防治方法：及时通风，适时浇水，增强韭菜的耐热能力。
二、死株
1.根腐病造成根死株死。韭菜根腐死亡有三种情况：一是窒息性根腐，在韭田堆放畜禽粪便或杂物，引起局部高温，使韭根处于无氧呼吸，造成乳酸和乙醇中毒。二是积水引起根腐。浇冻水不当造成地面积水，冻融交替根受损或低温水浸引起根死亡。三是用污染水或坑塘水浇灌，使土壤被破坏或韭根直接中毒死亡。防治方法：保持韭田清洁，避免杂物堆积；适时浇水，不用污染水浇灌。
三、茎叶腐烂多由病害引起，主要病害是韭菜疫病和灰霉病。
1.疫病。危害整个部位。发病时从叶下部产生水浸状暗绿色病斑，扩展至叶子一半时全叶变黄，萎蔫下垂。
防治方法：一是平整土地。
2.灰霉病。发病初期叶片产生灰褐色或白色小斑点，以后病斑扩大，由叶尖开始霉腐干枯，湿度大时产生灰色绒毛状霉层。高湿是发病的主要因素，相对湿度85%以上发病严重。高温高湿韭菜生长快，抗病力差，昼夜温差大，或放底风韭菜受冻，发病严重。
防治方法：一是选择抗病品种。二是加强放风，降低湿度。三是控制头刀韭菜最高温度不超过23℃，昼夜温差在10℃左右。
