有机蔬菜病虫草害防治是有机栽培管理中最为重要的环节，需坚持“预防为主，综合防治”的原则。防治方法包括选用抗病品种、嫁接、高温消毒、农业管理、轮作或多样化间作套种、物理及生物防治等，通常采用多种措施综合防治病虫草害。

　　一、选用抗性品种

　　在有机蔬菜生产中，除避免使用转基因种子和禁用物质处理的种子外，还要注意选择抗病虫、抗逆性强的蔬菜种类和品种。优先选择种类，如：菠菜、甜菜、芹菜、茴香、香菜、莴苣、茼蒿、紫苏、薄荷、韭菜、葱等。优先选择品种，如：番茄中的抗线虫品种仙客1号、黄瓜中的抗枯萎病品种长春密刺等。

　　二、嫁接

　　如茄子嫁接茄砧1号可有效防止黄萎病和根结线虫病的发生，西瓜和黄瓜嫁接京欣砧1号可有效防止枯萎病的发生。

　　三、高温消毒

　　1.种子高温消毒

　　将种子放入50~60℃(如黄瓜)或70~　80℃　(如辣椒)的热水中，浸泡15~30分钟可有效杀死种子所带病原菌和虫卵;将干燥种子置于　70℃　烘箱中处理2~3天，可钝化种子上附着的病毒。

　　有机蔬菜栽培是指在蔬菜生产过程中不使用化学合成的农药、肥料、除草剂和生长调节剂等物质，以及基因工程生物或产物，而是遵循自然规律和生态学原理，采取一系列可持续发展的农业技术来协调种植平衡，并维持农业生态系统持续稳定的蔬菜栽培技术，产品经过有机认证机构鉴定认可，生产合格的蔬菜为有机蔬菜，并颁发有机证书。